Was ist protocols.io?

protocols.io ist ein kostenloses, frei zugängliches Repository für Dokumentation und Austausch von detaillierten, up-to-date Forschungsmethoden und -protokollen. Es ermöglicht Forscher:innen, ihre Protokolle einfach zu erstellen, zu bearbeiten und zu teilen sowie dafür gewürdigt zu werden. protocols.io bietet Wissenschaftler:innen außerdem eine offene Plattform zur Kommunikation über Verbesserungen und Korrekturen an wissenschaftlichen Methoden.

Die Plattform ist für Forscher:innen nützlich, die in Disziplinen arbeiten, welche häufig eine schrittweise Methodik verwenden, wie z. B. in Biologie, Biowissenschaften, Medizin, Gesundheitswissenschaften, Chemie, Neurowissenschaften, Ingenieurswissenschaften, Datenwissenschaften und Informatik.

Ende der institutionellen Lizenz von protocols.io

Der vom BIH QUEST Center für alle Charité- und BIH-Nutzenden bereitgestellte Premiumdienst protocols.io endet aus Kostengründen zum 31. Dezember 2024.

Weitere Informationen und FAQs (in Englisch)

Features

Mit dem protocols.io Editor ist es möglich, ein Protokoll in wenigen Minuten zu erstellen und zu ändern. Protokolle können von Grund auf neu erstellt oder hochgeladen oder einfach aus einem vorhandenen Word- oder PDF-Dokument konvertiert werden.

Protokolle und ihre Änderungen können entweder für jedermann einsehbar veröffentlicht oder für Einzelpersonen freigegeben werden. Aktualisierungen von Protokollen können in einer Versionierung festgehalten werden. Öffentlich geteilte Protokolle können mit DOIs versehen werden, die dann leicht auffindbar und in ihrer Publikation oder auch unabhängig, als separates Forschungsergebnis, zitierbar sind.

Weitere Informationen zur den Features, die Protocols.io Ihnen bietet, finden Sie hier (in Englisch).

Limitation

Das Basiskonto ist auf 2 Privatprotokolle beschränkt. Sobald ein privates Protokoll veröffentlicht ist, kann ein weiteres privates Protokoll erstellt werden.

Vorteile

  • Die Protokolle sind dynamisch und interaktiv und helfen bei der Zusammenarbeit innerhalb einer Gruppe oder zwischen Co-Autor:innen außerhalb der Universität
  • Kontinuierliche Verbesserung und Entwicklung: Benutzer:innen, die Zugang zu einem Protokoll haben, können es aktualisieren, mit Anmerkungen versehen, kopieren oder aufspalten
  • Forschungsgruppen können ihre Methoden organisieren und archivieren, um sicherzustellen, dass das Wissen nicht verloren geht, wenn Beteiligte weiterziehen
  • Sie können verschiedene Zugriffsebenen für jedes Protokoll erstellen
  • Interoperabilität mit GitHub, OSF, RSpace, SciNote und LabArchives
  • protocols.io wird in den meisten Browsern und auf den meisten Geräten angezeigt - keine Apps oder Plugins erforderlich. Sie können das Protokoll Schritt für Schritt parallel zu Ihrem Experiment ausführen, eine Laufaufzeichnung speichern und diese sichern
  • Verbinden Sie Ihr protocols.io-Konto mit Ihrer ORCID und Informationen über Ihre veröffentlichten Protokolle werden automatisch im Abschnitt "Works" Ihres ORCID-Eintrags veröffentlicht
  • Wenn Sie Ihr veröffentlichtes Protokoll in Ihrer Publikation zitieren, können Sie Ihren Methodenteil erheblich verkürzen, der sich dann auf die breitere Ebene der angewandten Methodik konzentriert
  • Empfangen und geben Sie Feedback durch Bestätigung ("Works for me") und Kommentierung zu Schritten
  • Der Ausführungsmodus ermöglicht die Ausführung eines gesamten Protokolls als Checkliste neben Ihrem Experiment, sodass Sie wissen, wann jeder Schritt abgeschlossen wurde. Video-Tutorials (in Englisch): https://www.protocols.io/help/run

protocols.io FAQ

  • protocols.io FAQ

    Wer kann meine Protokolle sehen?

    Private Protokolle sind nur für Ersteller:innen und die Personen zugänglich, denen Ersteller:innen den Zugriff gewähren. protocols.io greift nur auf Ihre Protokolle zu, wenn Sie dies wünschen. Auf freigegebene Protokolle in privaten Arbeitsbereichen kann niemand außerhalb der Gruppe zugreifen oder sie freigeben.

    Was passiert, wenn ich mein veröffentlichtes Protokoll aktualisiere, das ich in einer Publikation mit einem DOI verknüpft habe?

    Oft entwickeln sich Protokolle weiter oder benötigen kleinere Korrekturen und Anpassungen, sodass eine neue öffentliche Version erstellt werden muss. Benutzer:innen, die über die Veröffentlichung auf das Protokoll zugreifen, erhalten die ältere Version zusammen mit einem Hinweis, dass eine neuere Version dieses Protokolls existiert.

    Wer hat eigentlich das Urheberrecht für eine bestimmte Methode? Kann ich bereits veröffentlichte Methoden eingeben?

    Ja, das können Sie. Rezepte und Kochbücher unterliegen nicht dem Urheberrecht. Es handelt sich um Tatsachenbehauptungen/Anweisungen, und daher können Protokollschritte und Materialien außerhalb der Originalzeitschrift erneut veröffentlicht werden. (Bitte fügen Sie jedoch keine direkten Kopien von Abbildungen, Tabellen, Diskussionen usw. aus veröffentlichten Artikeln ein - es sei denn, der Artikel ist vollständig frei zugänglich mit einer CC-BY-Lizenz, da dies einen Verstoß gegen das Urheberrecht darstellen würde).

    Wenn Sie auf einem veröffentlichten Protokoll oder Forschungsartikel aufbauen, ihn neu verwenden und/oder Text wiederverwenden, stellen Sie bitte sicher, dass Sie alle ursprünglichen Quelldokumente korrekt zitieren und zuordnen. Wenn protocols.io von einer Überschneidung mit einer bereits veröffentlichten Arbeit erfährt, die nicht zitiert wurde, werden Autor:innen mit der Bitte kontaktiert, die Zitate in eine neue Version aufzunehmen.

    Weitere Fragen und Antworten (in Englisch): https://www.protocols.io/help/faq

protocols.io Reward Programm

  • protocols.io 1.000 € Reward Programm

    Dieser Reward von jeweils 1.000 € wurde im Jahre 2023 insgesamt viermal für neu erstellte und öffentlich geteilte Protokolle von BIH oder Charité Mitgliedern vergeben. Dazu mussten sich die Ersteller aktiv bewerben und die Protokolle bestimmte Qualitätsmerkmale erfüllen.

    Die Gewinner:innen finden Sie hier. 

Teaching: Workshop "Mein Protokoll schreiben" (in Englisch)

In diesem Workshop arbeiten die Teilnehmenden daran, ein wiederverwendbares Schritt-für-Schritt-Protokoll zu schreiben oder ein bestehendes eigenes Protokoll zu verbessern. Sie absolvieren eine Übung, um ihr Protokoll schnell zu strukturieren, und nutzen ein Online-Protokoll-Repository, um die Lesbarkeit zu verbessern. 

Weitere Informationen finden Sie hier. 

Kontakt

Dr. René Bernard

Qualitätsmanager | Projektmanager - Value and Open Science (Exzellenzcluster NeuroCure, Charité)

Telefon:
+49 30 450 539 706
E-Mail:
rene.bernard[at]charite.de