Dr. Oliver Klein
- E-Mail:
- oliver.klein[at]charite.de
- Anschrift:
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Rahel Hirsch Center für Translationale Medizin (RHC)
BIH Spatial Diagnostics Platform (SDP)
Mit der BIH Spatial Diagnostics Platform gestalten wir die Zukunft der translationalen Medizin. Durch die Kombination von 3D-Histologie, Spatial Multiomics und integrativer Datenanalyse entwickeln wir Workflows der nächsten Generation für die Präzisionsdiagnostik. Unser ganzheitlicher Ansatz verbindet interdisziplinäre Daten aus Gewebeproben mit klinischen Langzeit-Follow-up-Daten, um molekulare Signaturen zu identifizieren, die mit dem Krankheitsverlauf und dem Ansprechen auf Therapien in Zusammenhang stehen.
Diagnostische Bedeutung der BIH Spatial Diagnostics Platform
Die Medizin der Zukunft ist datengestützt, präzise und schnell. Mit der neuen BIH Spatial Diagnostics Platform am Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) setzen wir exzellente Gesundheitsforschung in greifbare Realität um. Indem wir alle relevanten Technologien und Fachkenntnisse auf einer einzigen Plattform bündeln und ins Herz der Charité - Universitätsmedizin Berlin verlagern, beseitigen wir bestehende Hindernisse und heben die Gewebediagnostik auf ein neues Niveau. Als wegweisendes Projekt schlägt diese strategische Allianz zwischen interdisziplinärer Wissenschaft und starken Partnern aus der Industrie eine Brücke zwischen Spitzenforschung und direkter Patientenversorgung.
Stationen der Plattform
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3D-Histologie
Im Kern unserer Spatial Diagnostics Platform setzen wir moderne Technologien ein, um klassische histologische Arbeitsabläufe zu optimieren. Mithilfe von optischer Klärung, Fluoreszenzmarkierung mit sogenannten Nanobodies und modernster Lichtblattmikroskopie erstellen wir schnelle optische Schnitte und bauen zügig ein vollständiges, hochauflösendes digitales Modell der menschlichen Gewebemorphologie auf. Wir arbeiten an einer vollautomatischen Probenvorbereitung, Probenhandhabung und Bildgebung, um eine objektive und reproduzierbare Hochdurchsatzdiagnostik zu ermöglichen.
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Bildgestützte Multi-Omics
Die 3D-Histologie ist gewebeschonend und von Haus aus digital, was es uns ermöglicht, relevante Gewebebereiche präzise anzusteuern, um einen mehrschichtigen molekularen Stapel zu erstellen und Genotyp, molekularen Zustand und räumlichen Phänotyp miteinander zu verknüpfen. Wir fördern die Proteomik zur molekularen Identifizierung und Quantifizierung mit hoher Tiefe. Darüber hinaus nutzen wir MALDI-Imaging für die molekulare Histologie, mit der wir die Tumormikroumgebung abbilden und Heterogenitäten analysieren können. Durch die Einbeziehung modernster Sequenzierung mittels Expansion identifizieren wir die vorgelagerten Treiber wie Mutationen und epigenetische Zustände.
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Integrative Datenanalyse
Wir nutzen die Hochleistungsrechnerinfrastruktur am BIH und an der Charité, um umfangreiche Rohdaten aus bildgebenden Verfahren und molekularen Analysen zu integrieren. Die zentrale Datenverarbeitung und Hochleistungsrechner in Kombination mit maschinellem Lernen und fortschrittlicher Datenvisualisierung werden uns helfen, neue Erkenntnisse über menschliche Gewebeproben zu gewinnen.
Ansprechpartner: Strategie & Multiomics
Dr. Dr. Rene Hägerling
- E-Mail:
- rene.haegerling[at]charite.de
- Anschrift:
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Rahel Hirsch Center für Translationale Medizin (RHC)