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Was ist protocols.io?

protocols.io ist ein kostenloses, frei zugängliches Repository für Dokumentation und Austausch von detaillierten, up-to-date Forschungsmethoden und -protokollen. Es ermöglicht Forscher:innen, ihre Protokolle einfach zu erstellen, zu bearbeiten und zu teilen sowie dafür gewürdigt zu werden. protocols.io bietet Wissenschaftler:innen außerdem eine offene Plattform zur Kommunikation über Verbesserungen und Korrekturen an wissenschaftlichen Methoden.

Die Plattform ist für Forscher:innen nützlich, die in Disziplinen arbeiten, welche häufig eine schrittweise Methodik verwenden, wie z. B. in Biologie, Biowissenschaften, Medizin, Gesundheitswissenschaften, Chemie, Neurowissenschaften, Ingenieurswissenschaften, Datenwissenschaften und Informatik.

Features

Mit dem protocols.io Editor ist es möglich, ein Protokoll in wenigen Minuten zu erstellen und zu ändern. Protokolle können von Grund auf neu erstellt oder hochgeladen oder einfach aus einem vorhandenen Word- oder PDF-Dokument konvertiert werden.

Protokolle und ihre Änderungen können entweder für jedermann einsehbar veröffentlicht werden oder sie können für ausgewählte private Gruppen oder Einzelpersonen freigegeben werden. Aktualisierungen von Protokollen können in einer Versionierung festgehalten werden. Öffentlich geteilte Protokolle können mit DOIs versehen werden, die dann leicht auffindbar und in ihrer Publikation oder auch unabhängig, als separates Forschungsergebnis, zitierbar sind.

Weitere Informationen zur den Features, die Protocols.io Ihnen bietet, finden Sie hier (in Englisch).

Berechtigungen

Das BIH QUEST Center bietet diesen Service für Studierende, Lehrende und Mitarbeiter:innen des BIH und der Charité zunächst für 2 Jahre an (bis 31.12.2024).

Wenn ein protocols.io-Account mit einer "charite.de"- oder "bih-charite.de"-E-Mail-Adresse angelegt wird, werden die Premium-Funktionen nach der Account-Erstellung und der Bestätigung per Nummerncode an die E-Mail-Adresse automatisch aktiviert.

Für bestehende protocol.io-Konten werden die Premium-Funktionen automatisch aktiviert. (Es ist auch möglich, ein bestehendes Konto, das mit einer "nicht mit der Charité assoziierten" E-Mail-Adresse erstellt wurde, durch Validierung mit einer Charité-E-Mail zu aktualisieren). Siehe FAQ unten.

Premium Zugang

Der Premium-Zugang bietet Ihnen Folgendes:

  • Unbegrenzte private Repositories
  • Einzelschulung durch Mitarbeiter:innen von protocols.io
  • Privater oder offener Arbeitsbereich mit bis zu neun Nicht-Charité/BIH-Mitgliedern
  • Import eines bestehenden Protokolls auf die protocols.io-Plattform
  • Dediziertes Konto und Kundenservice mit 24 Stunden Bearbeitungszeit Audit Trail und elektronische Unterschrift für 21 CFR Part 11

Vorteile

  • Die Protokolle sind dynamisch und interaktiv und helfen bei der Zusammenarbeit innerhalb einer Gruppe oder zwischen Co-Autor:innen außerhalb der Universität
  • Kontinuierliche Verbesserung und Entwicklung: Benutzer:innen, die Zugang zu einem Protokoll haben, können es aktualisieren, mit Anmerkungen versehen, kopieren oder aufspalten
  • Forschungsgruppen können ihre Methoden organisieren und archivieren, um sicherzustellen, dass das Wissen nicht verloren geht, wenn Beteiligte weiterziehen
  • Sie können verschiedene Zugriffsebenen für jedes Protokoll erstellen
  • Interoperabilität mit GitHub, OSF, RSpace, SciNote und LabArchives
  • protocols.io wird in den meisten Browsern und auf den meisten Geräten angezeigt - keine Apps oder Plugins erforderlich. Sie können das Protokoll Schritt für Schritt parallel zu Ihrem Experiment ausführen, eine Laufaufzeichnung speichern und diese sichern
  • Verbinden Sie Ihr protocols.io-Konto mit Ihrer ORCID und Informationen über Ihre veröffentlichten Protokolle werden automatisch im Abschnitt "Works" Ihres ORCID-Eintrags veröffentlicht
  • Wenn Sie Ihr veröffentlichtes Protokoll in Ihrer Publikation zitieren, können Sie Ihren Methodenteil erheblich verkürzen, der sich dann auf die breitere Ebene der angewandten Methodik konzentriert
  • Empfangen und geben Sie Feedback durch Bestätigung ("Works for me") und Kommentierung zu Schritten
  • Der Ausführungsmodus ermöglicht die Ausführung eines gesamten Protokolls als Checkliste neben Ihrem Experiment, sodass Sie wissen, wann jeder Schritt abgeschlossen wurde. Video-Tutorials (in Englisch): https://www.protocols.io/help/run

protocols.io FAQ

protocols.io Reward Programm

Charité/BIH @protocols.io Collection

Teaching: "Write and/or Publish My Protocol Working Group" (in Englisch)

Wir bieten einen Kurs zum selbstständigen Studium an, der Wissenschaftler:innen bei den verschiedenen Schritten von der Erstellung bis zur Veröffentlichung von Protokollen unterstützt. Die Kursmodule helfen Ihnen bei folgenden Punkten: 

  • Planung und Erstellung eines wiederverwendbaren Schritt-für-Schritt-Protokolls
  • Ihr Protokoll mit Kolleg:innen vor Ort und auf der ganzen Welt zu teilen, indem Sie es auf protocols.io hinterlegen
  • Ihr gemeinsames Protokoll im Methodenteil Ihrer Arbeit zu zitieren
  • Sie bereiten einen Artikel über Laborprotokolle vor, in dem Sie neuartige Methoden beschreiben, die Sie entwickelt haben, um sie bei PLOS One einzureichen.

Die Kursvideos können auf YouTube angesehen werden. Jedes Video wird Sie durch einen der oben aufgeführten Schritte führen. Die Kursteilnehmer:innen werden untereinander und mit den Kursleiter:innen über MS Teams interagieren und an zweiwöchentlichen Arbeitsgruppensitzungen teilnehmen, in denen die Teilnehmer:innen an ihren Protokollen arbeiten und Tipps und Feedback erhalten können.

Die Klassengröße ist begrenzt, um sicherzustellen, dass die Teilnehmer:innen die Möglichkeit haben, sich in einer kleinen Gruppe auszutauschen und Feedback zu ihrer Arbeit zu erhalten.

Weitere Informationen und Registrierung hier.

Dr. René Bernard

Qualitätsmanager | Projektmanager - Value and Open Science (Exzellenzcluster NeuroCure, Charité)

Kontaktinformationen
Telefon:+49 30 450 539 706
E-Mail:rene.bernard@charite.de