Tissue Typing
Unser Team arbeitet daran molekulare Prozesse, zelluläre Faktoren sowie strukturelle und funktionelle Veränderungen, welche zu der Heilung und Erkrankung von menschlichen Geweben führen, besser zu verstehen und zu identifizieren. Im Focus stehen dabei die Entwicklungen neuartiger Therapieansätze und Diagnose/Prognose Systeme für die Behandlung multifaktorieller Erkrankungen mittels Proteomanalyse zu unterstützen.
Services
Bildgebende Massenspektrometrie, zur histopathologischen Bestimmung molekularer (Proteine, Peptide, Metabolite), zellulärer beziehungsweise struktureller Veränderungen direkt im Gewebeschnitt.
Charakterisierung von räumlichen und zeitlichen Proteinveränderungen im Gewebe als Konsequenz irreversibler Prozesse (z.B. Tumorwachstum) bzw. regenerativer Prozesse als Antwort auf eine Therapie.
Entwicklung von molekularen Klassifikatoren für die Therapie Stratifizierung und Diagnose/Prognose Systemen
Qualitative und quantitative Proteincharakterisierung von Biomaterial, therapeutischen Zellprodukten, Körperflüssigkeiten oder Gewebe.
OpenIRIS
Der Zugang zu Geräten und Services erfolgt über die Plattform OpenIRIS.
Team
Methoden
Beurteilung des Gewebes: Bestimmung räumlicher molekularer Signaturen (Proteine, Peptide, Metabolite), mittels bildgebender Massenspektrometrie
Semi-quantitative Proteinanalyse mittels ultrahochauflösender Hochdurchsatz-Massenspektrometrie von Gewebe, Zellen, Körperflüssigkeiten oder Biomaterial
Ausstattung
MALDI Tissue Typer Massenspektrometer (Rapiflex ;Bruker Daltonik, 2017)
Autoflex III MALDI TOF Massenspektrometer (Bruker Daltonik, 2009)
ESI-QTOF Massenspektrometer (Impact II; Bruker Daltonik,2017)
nano HPLC (Ulitmate 3000 Dionex, 2017)
nano HPLC (Proxeon))
Sprayer Device (HTX –TM-Sprayer 2017)
Whole Slide Imaging Scanner (NanoZoomer-SQ, Hamamatsu 2018)
Funding
BMBF MSTAR- within the MSTARS joint project, a local research core for mass spectrometry in systems medicine is to be established in Berlin. Bundle and expand. The aim is to develop prognostic biomarkers, to investigate the problem of resistance to therapy in greater depth and to achieve improvements in drug development and study design.
EU-Reshape- transforming the treatment of patients suffering from undesired Immunity/Inflammation and Regenerative Medicine, including Gene Therapy) who presently have limited curative treatment options by applying next-generation Treg approaches.
Pfizer Aspire- In situ diagnostic for transthyretin amyloidosis stratification in heart failure with preserved ejection fraction using imaging mass spectrometry
DZHK-Phenomics in HFpEF Combination of biostatistical phenotyping and innovative systems biology approaches (proteomics) HFpEF subpopulation stratification
BIH-CRG-Terminat NB Deeper understanding of signaling networks driving neuroblastoma treatment failure will drive rational design of the most effective targeting strategies for patient subgroups selected precisely according to individual risk and molecular biomarker profiles.
Kooperationen
Internal (BCRT)
Musculoskeletal System (Prof. Duda)
Field Cardiovaskular System (Prof. Tschöpe, Prof. Stamm/ Sophie van Linthout))
Field Immunsystem- (Prof. Reinke, Prof. Volk)
Charité
Julius Wolff Institute (Prof. Duda/Sven Geissler)
Dept. of Cardiology (Prof. Pieske/Prof. Tschöpe/Sophie van Linthout)
Inst. Med. Immunology (Prof. Volk, Dr. Sabat)
Gynecology and Center for Oncological Surgery (Prof. Sehouli/Dr. Kulbe)
Dept. of Pediatrics, Division of Oncology and Hematology (Prof. Eggert)
Division of Nephrology and Internal Intensive Care Medicine (Prof. Reinke)
Institute of Pathology (Prof. Klauschen/Dr. Taube)
Institute for Radiology(Prof. Schellenberger)
External collaboration
UKSH Lübeck – Translational Surgical Oncology & Biomaterial Banks (Prof. Gemoll)
UKSH Lübeck – Dept. of Cardiac and Thoracic Vascular Surgery (Prof. Mohamed)
Institute of Pathology Celle (Prof. Wellmann)
UBC-Depart of Pathology and Laboratory Medicine (Prof. Kalloger), Canada
Fraunhofer MEVIS Lübeck (Prof. Thiele/Prof. Lellmann)
Institute f. Clinical and Experimental Medicine (Prof. Viklický/Prof. Honsová), Czechia
Industry
Bruker Daltonik GmbH, Bremen
Pfizer