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Ein Modul für die Charité Health Data Platform (HDP)

Der Virtual Research Environment (VRE, dt. Virtuelle Forschungsumgebung) ist in die Charité Health Data Platform (HDP) integriert und erweitert deren Funktionalitäten. Die HDP wird innerhalb des BIH Translation Hub Digitale Medizin entwickelt und hat die Aufgabe, Patientendaten aus der Charité für die Forschung zur Verfügung zu stellen. Es setzt sich aus vielen verschiedenen Komponenten zusammen, wie einem Data Lake, einer Clinical Data Zone und einer Research Data Zone. 

Ziel des VRE ist es, den Forschern den sicheren Zugang zu den Daten und ihre Nutzung auf innovative Weise zu erleichtern. Die Charité Health data Platform wird das VRE mit neuen Elementen erweitern:

  • Arbeitsabläufe für radiologische Bilddaten
  • ein Modell für die Katalogisierung und leichtere Auffindbarkeit der Daten
  • Arbeitsumgebungen für die Modellierung, Simulation und Analyse von Daten
  • ein Portal, das auch für externe Benutzer, die nicht der Charite angehören, offen ist
  • Interoperabilität mit internationalen Datengemeinschaften, wie sie im Rahmen der European Open Science Cloud entwickelt wurden, z.B. die Virtual Brain Cloud oder das Human Brain Project.

Wir folgen den FAIR-Leitprinzipien für wissenschaftliches Datenmanagement – Findability, Accessibility, Interoperability, Reusability. Wir wollen sicherstellen, dass diese Entwicklung für alle Kliniker*innen und Wissenschaftler*innen der Charité und des BIH offen und zugänglich ist, damit wir die drängenden medizinischen Herausforderungen der heutigen Zeit gemeinsam lösen können!

Zugang VRE Portal

Klicken Sie hier für den Zugang zum VRE-Portal

Für weitere Informationen oder um herauszufinden, wie Sie auf den VRE zugreifen können, wenden Sie sich bitte an vre-support@charite.de

Explained in the video: How does the VRE work?

VRE Portal Demonstration – Release January 2021

Use Virtual Desktop Applications with the VRE

Use Jupyter workbench to process data in the VRE

VRE Architecture

  • VRE Architecture

    How is the Virtual Research Environment (VRE) structured? What other infrastructures does the platform interface with and enable researchers to access and use data securely?

    Mehr erfahren

News

Key facts

Das VRE ist ein Projekt des Translation Hub Digitale Medizin in Zusammenarbeit mit der Business Division IT und dem Industriepartner Indoc.

Projektleiterin ist Professor Dr. Petra Ritter, Sektion Gehirnsimulation, Abt. Neurologie

Der VRE wird vom Berlin Institute of Health finanziert.

Erste Entwicklungsphase: April 2020 - Juni 2021

Use Cases werden in Zusammenarbeit mit Prof. Dr. Carsten Finke für die Entwicklung des UseCase Generate und der Virtual Brain Cloud entwickelt (Leitung Prof. Dr. Petra Ritter).

Projektplan

See the VRE draft project schedule showing the major deployment stages (represented as orange and purple bars), with associated tasks and timelines.

Kontakt

Prof. Dr. Petra Ritter

BIH Johanna Quandt Professorin für Gehirnsimulation

Kontaktinformationen
Anschrift:Campus Charité Mitte
Charitéplatz 1

10117 Berlin
Telefon:+49 30 450 560 005
E-Mail:petra.ritter@charite.de